科学的ブレイクスルーは優れたデータから得られる洞察の上に築かれますが、時には膨大なデータの海に埋もれてしまうことがあります。カリフォルニア再生医療研究所（CIRM）は、この問題に対処するため、新たなインフラストラクチャ・プログラムを承認しました。
CIRMは最近、同研究所が資金提供する研究から得られた膨大かつ複雑な生物学的データセットを解明するためのツール構築への投資を承認しました。このプログラムは、再生医療データを統合し、そこから新たな洞察を引き出すための新しいソフトウェア開発を目的としています。
「私たちの使命が私たちを前進させています」と、CIRMのシニアサイエンスオフィサーであるジェニ・バイラム氏は理事会で述べました。「私たちは、CIRMの投資価値を最大限に高め、科学を前進させ、データ活用の新しい方法を創出するためのツールと戦略を開発しています。」
この新プログラムでは、10百万ドルを割り当て、各500千ドルの助成金を15～20件提供します。各プロジェクトは、データ統合の具体的な課題に取り組みます。あるツールは異なる種類のデータを連携させ、また別のツールは再生医療のニーズに合わせて調整された広く利用されているオープンソースソフトウェアを改善またはサポートします。プロジェクトの一部は、現代のコンピューティングや人工知能の能力に対応できるよう、既存のソリューションを更新する予定です。
データサイエンスおよびソフトウェアエンジニアリング賞（Data Science and Software Engineering Awards）は、さまざまな種類の生物医学データを統合するオープンソースツールの構築を目指しています。CIRMは、これらのデータを使いやすい形で結合することで、疾患治療のための新しい創薬ターゲットやバイオマーカーの特定と検証が加速すると考えています。
これは、研究者がデータセットをより迅速に扱えるようにするインフラストラクチャの構築を目指すものです。特に、再生医療の研究や臨床試験で生成される多様なデータを、容易に共有可能な形式に変換できるソフトウェアに重点が置かれています。
数年前、NIHは連邦研究によるペタバイト規模の生物医学データを統合するための「Biomedical Data Translator」プログラムという同様のイニシアチブを開始しました。CIRMもまた、すでに800件以上のCIRMデータセットを収容し、研究者がよりアクセスしやすくしている「Data Explorer」ツールなど、データ共有へのこれまでの独自の投資を基盤としています。
複雑なデータを理解するという問題は、政府の研究において長年の課題です。2014年、NIHの元所長フランシス・コリンズ氏は、データの波が押し寄せ、研究者が圧倒される可能性があると議会に警告しました。それ以来、データの規模と複雑さは増すばかりです。CIRMのプロジェクトや臨床試験ではすでに1200件以上のデータセットが生成されており、それらを結合するためのソフトウェアツールの必要性が高まっています。
一部のツールはすでに異なる種類の生物医学データを組み合わせていますが、多くのオープンソースシステムは、現代のコンピューティングやAIに対応するために更新が必要です。新しく、あるいは改良されたソフトウェアは、再生医療研究者のニーズによりよく応えることができます。異なる種類のデータを統合する目的は、研究を加速させ、CIRMの初期投資を最大限に活用することであるとバイラム氏は強調しました。
オープンで透明性が高く、再利用可能かつ拡張性のあるソフトウェアは、これらの障壁を克服するために必要なインフラストラクチャを提供できます。CIRMは申請者に対し、ツールの構築だけでなく、その展開、利用、サポート、そして時間の経過に伴う改善についても考えるよう求めています。同研究所は、異なるシステム、データタイプ、研究コンテキストで機能する、広範な影響力を持つツールプロジェクトを求めています。
データサイエンスは急速に進化しており、人気のあるツールであっても定期的な更新が必要です。この投資は、研究者がコンピューティングやAIの進歩、そして常に変化する新しい研究データの状況に遅れずについていくことを支援します。支援を受けるオープンソースソリューションの開発者は、断片化されたデータを意味のある発見へと変えることができるようになるでしょう。
