تُبنى الإنجازات العلمية على الرؤى المستمدة من البيانات الجيدة، ولكنها أحياناً ما تظل محجوبة تحت محيط من كثرة المعلومات. هذه هي المشكلة التي قرر معهد كاليفورنيا للطب التجديدي (CIRM) التصدي لها من خلال الموافقة على برنامج بنية تحتية جديد.
وافق CIRM مؤخراً على استثمارات لإنشاء أدوات تساعد في فهم مجموعات البيانات البيولوجية الضخمة والمعقدة الناتجة عن الأبحاث التي يمولها المعهد. يهدف البرنامج إلى تطوير برمجيات جديدة لدمج بيانات الطب التجديدي واستخلاص رؤى جديدة منها.
قالت جيني بايرام، كبيرة الباحثين العلميين في CIRM، خلال اجتماع المجلس: «مهمتنا تدفعنا للأمام. نحن نطور أدوات واستراتيجيات لتحقيق أقصى استفادة من قيمة استثمارات CIRM، من خلال دفع عجلة العلم وابتكار طرق جديدة للتعامل مع البيانات».
يخصص البرنامج الجديد 10 ملايين دولار لتقديم ما بين 15 و20 منحة، بقيمة 500 آلاف دولار لكل منها. سيعالج كل مشروع تحدياً محدداً في دمج البيانات؛ حيث ستربط بعض الأدوات أنواعاً مختلفة من البيانات، بينما ستعمل أدوات أخرى على تحسين أو دعم البرمجيات مفتوحة المصدر واسعة الاستخدام والمكيفة لاحتياجات الطب التجديدي. وستقوم بعض المشاريع بتحديث الحلول الحالية لتتوافق مع الحوسبة الحديثة وقدرات الذكاء الاصطناعي.
تهدف جوائز Data Science and Software Engineering Awards إلى إنشاء أدوات مفتوحة المصدر تدمج أنواعاً مختلفة من البيانات الطبية الحيوية. وبحسب رؤية CIRM، فإن ربط هذه البيانات في شكل سهل الاستخدام سيسرع من عملية تحديد والتحقق من أهداف الأدوية الجديدة والمؤشرات الحيوية لعلاج الأمراض.
يتعلق الأمر بإنشاء بنية تحتية تسمح للباحثين بالعمل مع مجموعات البيانات بشكل أسرع. ويتم التركيز بشكل خاص على البرمجيات القادرة على تحويل تنوع البيانات الناتجة عن الأبحاث والتجارب السريرية في الطب التجديدي إلى تنسيق يسهل تبادله.
قبل عدة سنوات، أطلقت NIH مبادرة مماثلة، وهي برنامج Biomedical Data Translator لدمج بيتابايتات من البيانات الطبية الحيوية من الأبحاث الفيدرالية. ويعتمد CIRM أيضاً على استثماراته السابقة في تبادل البيانات، بما في ذلك أداة Data Explorer التي تحتوي بالفعل على أكثر من 800 مجموعة بيانات من CIRM وتجعلها أكثر سهولة في الوصول للباحثين.
لطالما واجهت الأبحاث الحكومية مشكلة فهم البيانات المعقدة. ففي 2014، حذر المدير السابق لـ NIH فرانسيس كولينز الكونجرس من أن الموجة المتزايدة من البيانات قد تثقل كاهل الباحثين. ومنذ ذلك الحين، زاد حجم البيانات وتعقيدها فقط. وقد أنتجت مشاريع وتجارب CIRM السريرية بالفعل أكثر من 1200 مجموعة بيانات، مما عزز الحاجة إلى أدوات برمجية لربطها.
تجمع بعض الأدوات بالفعل بين أنواع مختلفة من البيانات الطبية الحيوية، ومع ذلك، فإن العديد من الأنظمة مفتوحة المصدر تتطلب تحديثات لتتواكب مع الحوسبة الحديثة والذكاء الاصطناعي. وتلبي البرمجيات الجديدة أو المحسنة احتياجات باحثي الطب التجديدي بشكل أفضل. وأكدت بايرام أن الهدف من دمج أنواع البيانات المختلفة هو تسريع الأبحاث وتحقيق أقصى استفادة من استثمارات CIRM الأولية.
يمكن للبرمجيات المفتوحة والشفافة والقابلة لإعادة الاستخدام والتوسع أن توفر البنية التحتية اللازمة لتجاوز هذه العوائق. ويطلب CIRM من المتقدمين التفكير ليس فقط في إنشاء الأداة، بل أيضاً في نشرها واستخدامها ودعمها وتحسينها بمرور الوقت. ويبحث المعهد عن مشاريع ذات تأثير واسع، وهي الأدوات التي تعمل عبر أنظمة وأنواع بيانات وسياقات بحثية مختلفة.
يتطور علم البيانات بسرعة، وحتى الأدوات الشائعة تحتاج إلى تحديثات منتظمة. يساعد هذا الاستثمار الباحثين على مواكبة التقدم في الحوسبة والذكاء الاصطناعي، وكذلك المشهد المتغير باستمرار لبيانات الأبحاث الجديدة. وسيكون بمقدور مطوري الحلول مفتوحة المصدر الذين سيحصلون على الدعم تحويل البيانات المجزأة إلى اكتشافات ذات مغزى.
