Perturb-DBiT:直接在组织中观测基因功能的新方法

想象一下,如果您想了解一座城市的运作方式。您可以将其拆解成单个砖块并逐一研究。您也可以同时观察街道、建筑、居民以及他们之间的相互作用。通过开发 Perturb-DBiT 这一新方法,研究人员正是迈出了这样关键的一步。

这项发表在《自然-生物技术》(Nature Biotechnology)杂志上的研究成果,能够在保留组织自然空间结构的同时,实现在组织切片中同步引入基因改变并分析基因活性。
大多数 CRISPR 筛选的难题在于,为了进行分析,通常必须将细胞相互分离。这样做会导致最关键的信息——细胞环境——消失。但在活体生物中,细胞的命运不仅受其基因影响,还取决于邻近细胞、周围信号以及它在组织中所处的位置。
Perturb-DBiT 使得保留这种空间图谱成为可能。科学家们能够同时引入基因变异,并实时观察整个组织切片内的细胞反应。从本质上讲,这绘制了一张详细的地图,不仅展示了哪些基因发生了改变,还揭示了这些改变如何影响周边的细胞。
该方法在肿瘤研究中可能具有特殊的应用价值。即使是同一肿瘤内的细胞,其表现也往往迥然不同:部分细胞对治疗反应良好,而另一些则具有耐药性。这种新方法有助于在自然的组织微环境中直接揭示这些差异产生的原因。
这是从研究孤立细胞向理解遗传改变在真实生物系统中如何运作迈出的重要一步。毕竟,组织并非只是细胞的简单集合,而是一个复杂的生态系统,在这个系统中,环境背景的重要性往往不亚于基因本身。




