माइक्रोबायोम जर्नल में एक अध्ययन प्रकाशित हुआ है, जिसमें एआरजी-पास (ARG-PASS) नामक एक तरीके का वर्णन किया गया है; यह एक ऐसा उपकरण है जो प्रोटीन अनुक्रम और संरचना के संरक्षित लक्षणों के आधार पर मानव माइक्रोबायोम में पहले से अज्ञात एंटीबायोटिक प्रतिरोध जीन (एआरजी) खोजने में सक्षम है।
एंटीमाइक्रोबियल प्रतिरोध (एएमआर) की समस्या सार्वजनिक स्वास्थ्य के लिए मुख्य खतरों में से एक बनी हुई है। मानव माइक्रोबायोम ऐसे जीनों के एक बड़े भंडार के रूप में कार्य करता है, हालांकि उनमें से कई को पहले से ज्ञात एआरजी के साथ कम समानता के कारण पारंपरिक तरीकों से खोजना मुश्किल है। शोधकर्ताओं ने प्रोटीन के कार्यात्मक रूप से महत्वपूर्ण हिस्सों पर ध्यान केंद्रित किया, जहाँ प्रमुख संरचनात्मक विशेषताएँ संरक्षित रहती हैं।
एआरजी-पास उपकरण एक-श्रेणी समर्थन वेक्टर विधि का उपयोग करता है और एआरजी द्वारा एन्कोड किए गए प्रोटीन के संरक्षित क्षेत्रों में प्राथमिक और तृतीयक संरचना के युग्मित वितरणों पर प्रशिक्षित होता है। इसे ह्यूमन माइक्रोबायोम प्रोजेक्ट के छह संदर्भ स्ट्रेन्स पर लागू किया गया और प्रायोगिक सत्यापन के लिए नौ उम्मीदवारों का चयन किया गया। ई. कोलाई में व्यक्त किए गए सभी नौ जीनों ने कार्यात्मक गतिविधि की पुष्टि की और उन्हें एएफपी (APH), डीएफआर (dfr), बीटा-लैक्टामेज (β-lactamases) वर्ग बी और सी, साथ ही पेनिसिलिन-बाइंडिंग प्रोटीन (पेनिसिलिन-बाध्यकारी प्रोटीन) की श्रेणियों में वर्गीकृत किया गया।
अतिरिक्त रूप से, इस विधि को सीधे अल्फाफोल्ड (AlphaFold) संरचना डेटाबेस पर लागू किया गया। इस प्रकार, phnP जीन की पहचान की गई, जो मेटालो-बीटा-लैक्टामेज (metallo-β-lactamases) प्रकार से संबंधित है। यह ज्ञात बीटा-लैक्टामेज के साथ कम समानता दर्शाता है, लेकिन एम्पीसिलीन के प्रति प्रतिरोध की पर्यावरण-निर्भर गतिविधि दिखाता है। सभी जांचे गए जीनों में से 80% सीएलएसआई (CLSI) दहलीज स्तर पर प्रतिरोध प्रदान करते हैं, जबकि शेष को
