OpenAI与合作伙伴展示AI如何将海量科学数据分析加速数百倍

编辑者: Tatyana Hurynovich

OpenAI showed that AI agents can handle the slowest step in modern biology, making sense of huge experiments. By splitting a huge brain experiment among 1,946 AI agents, OpenAI got in 32 minutes what it estimates would take people months: a ranked list of leads for new

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GPT-Rosalind surfaced a new lead for drug discovery: could restoring cholesterol transport protect neurons from degeneration? DCTN1 is a gene linked to Perry syndrome, a rare neurodegenerative disorder. In mouse-brain data, disrupting it increased expression of genes involved in

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OpenAI与生物技术公司PerturbAI以及Scripps Research共同展示了分布式AI智能体如何加速处理海量生物数据。

团队使用了数千个基于GPT-Rosalind的智能体来分析whole-brain CRISPR atlas——即关于基因扰动如何影响小鼠大脑数百万细胞的数据。每个智能体研究一个基因:分析细胞反应,在科学文献中寻找关联,并提出可能的解释。

整个过程耗时32分钟。研究人员估计,对单个基因进行类似的人工分析和文献综述可能需要数月到一年时间。

核心要点

AI并未进行新的实验,也未证明疾病的成因。它快速处理了已有数据,发现了规律,并提出了假说,现在科学家可以在实验室中对其进行验证。

研究结果被整合为一个reasoning atlas——一张将基因、细胞效应、科学出版物和可能机制联系起来的图谱。这样的图谱帮助研究人员不必手动翻查数据,而是能直接看到最有前景的方向。

为何重要

该项目的主要价值在于规模。数千个智能体并行梳理了数百万细胞的数据,并引用了超过700个科学来源。作为对比:在同一测试中,单个智能体仅使用了11个来源。

在盲测比较中,生物学家更常选择分布式智能体的报告——在75%的情况下如此。这并不意味着AI总是正确的,但表明该系统能够给出有用且论证充分的研究结论。

发现了什么

在假说中,有小脑内Tsc1和Tsc2基因作用的意外差异:Tsc2的扰动改变了数十个基因的活性,而Tsc1则几乎没有影响。

另一个例子与DCTN1基因有关,该基因的突变与一种罕见的神经退行性疾病——佩里综合征相关。该基因的扰动提高了参与胆固醇合成的基因的表达。这并非已确定的疾病成因,而是一条可能的线索,需要进一步验证。

下一步

Reasoning atlas已向研究人员开放:可用于寻找新假说和规划实验。

合作伙伴将该方法视为更快找到潜在药物靶点的一种途径。如果该方法能在其他数据上得到验证,它可能使新药研发更加系统化。但目前仍处于早期阶段:AI提出想法,最终结论仍取决于科学家和实验室实验。

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来源

  • Using thousands of AI agents to uncover new leads in biological data

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Great paper from Anthropic on AI agents doing ML-for-science research. (bookmark it) If you build AI-scientist systems, this one is worth your time. They propose Agent4Sci, which gives frontier coding agents 20 scientific ML benchmarks across 11 domains and asks them to beat

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