Исследователи из Университета Иллинойса в Чикаго (UIC) разработали SenePy, программную платформу с открытым исходным кодом, для идентификации преждевременно стареющих клеток, также известных как сенесцентные клетки. Эти клетки, которые прекращают расти, но не умирают, способствуют развитию таких заболеваний, как сердечно-сосудистые заболевания и болезнь Альцгеймера.
Марк Санборн, докторант UIC, проанализировал данные секвенирования отдельных клеток из более чем 1,6 миллиона клеток человека и мыши, чтобы создать SenePy. Инструмент идентифицирует генетические сигнатуры, которые отличают сенесцентные клетки от здоровых в различных тканях, включая сердце, легкие и мозг. Исследователи идентифицировали 72 сигнатуры мыши и 64 сигнатуры человека.
Д-р Джалис Рехман, ведущий автор и профессор Бенджамин Дж. Голдберг, заявил, что SenePy помогает исследователям изучать эти клетки, чтобы лучше понимать и лечить болезни. Платформа позволяет анализировать образцы тканей и сравнивать их с обнаруженной базой данных сигнатур.
Исследователи использовали SenePy для изучения роли сенесцентных клеток в развитии рака, сердечных приступов, COVID-19 и воспаления мозга. Они обнаружили, что сенесцентные клетки собираются вместе и что сенесценция может действовать как естественный тормоз образования опухолей. Команда также оценила эффективность сенолитических препаратов, которые очищают сенесцентные клетки, и выявила потенциальные новые цели для этих препаратов.