Нова відкрита рамкова система допомагає екологам оцінювати представлення генетичного різноманіття в насіннєвих банках, що сприяє захисту рослинних видів, які стикаються з загрозою вимирання. Це є вирішальним для збереження екосистем і забезпечення стійкості наших продовольчих систем.
Оскільки зміна клімату та втрата середовища існування прискорюються, багато рослинних видів перебувають під загрозою вимирання. Насіннєві банки та ботанічні сади відіграють важливу роль у збереженні генетичного різноманіття рослин. Проте менше 20% диких рослинних видів адекватно представлені в цих екс-ситу консерваційних зусиллях.
Марва Ель Грауї, аспірантка Університету Мохамеда VI Політехнічного (UM6P) в Марокко, розробила рамкову систему для вирішення цієї проблеми. Її метод використовує публічно доступні дані, геопросторове моделювання та зручне програмне забезпечення для оцінки представлення генетичного різноманіття в насіннєвих банках. Це дозволяє дослідникам пріоритизувати види, які потребують термінової охорони.
Робота Ель Грауї зосереджена на роді Vigna, але цей підхід може бути застосований до будь-якої групи рослин. Рамкова система використовує географічні та екологічні відстані між зразками як проксі для генетичної диференціації, особливо коли прямі геномні дані недоступні. Цей підхід базується на теорії ізоляції за відстанню, де популяції, що знаходяться далі одна від одної, мають тенденцію до генетичної дивергенції.
Щоб точно визначити ареал виду, Ель Грауї і її співавтор розробили метод "коригованого ареалу". Цей метод поєднує буфери включення для захоплення задокументованих зон появи та буфери виключення для видалення неправдоподібних територій, передбачених моделями розподілу видів (SDMs). Команда також вирішила проблеми з неточностями даних у записах екс-ситу збору, які значно вплинули на оцінки охорони.
Весь робочий процес упаковано у відкриту бібліотеку R, що робить її доступною для дослідників у всьому світі. Користувачі можуть вводити координати появи та кліматичні змінні, щоб згенерувати бал охорони для кожного виду. Цей відкритий підхід відповідає баченню UM6P, яке полягає у використанні цифрових інструментів та африканських даних для вирішення глобальних проблем.
Ця інноваційна рамкова система надає практичний інструмент для покращення представлення генетичного різноманіття в насіннєвих банках. Вона пропонує масштабоване та доступне рішення для нагальної проблеми охорони рослин, що приносить користь як екосистемам, так і суспільству. Поліпшуючи представлення генетичного різноманіття, ми можемо краще захистити рослинні види та забезпечити стійкість наших продовольчих систем для майбутніх поколінь.