MATQ-seq adlı çığır açan bir yöntem, bilim insanlarının tek tek bakteri hücrelerinin karmaşık dünyasına dalmalarını sağlıyor. Bu gelişmiş teknoloji, yüksek çözünürlüklü gen ekspresyon profilleri sağlayarak, bakterilerin stres ve antibiyotikler dahil olmak üzere çeşitli uyaranlara nasıl tepki verdiğine dair benzeri görülmemiş bilgiler sunuyor.
MATQ-seq, her hücrede aktif olan belirli genleri ortaya çıkaran mRNA'yı yakalayarak çalışır. Önceki yöntemlerin aksine, MATQ-seq hücrelerin yaklaşık %95'ini koruyarak bakteri davranışının daha doğru ve kapsamlı bir analizini sağlar. Bu gelişmiş tutma oranı, araştırmacıların konakçı nişlerindeki küçük bakteri popülasyonlarını veya hücre içi bakterileri bile incelemesine olanak tanır.
Teknik, hücre başına 300 ila 600 gen tespit edebilir ve metabolizma ve virülans gibi bakteri durumlarına dair derin bilgiler sağlar. Bilim insanları bu durumları anlayarak enfeksiyonlar için daha etkili ve hedefe yönelik tedaviler geliştirebilirler. Gelişmiş MATQ-seq protokolü, otomasyonu, daha verimli bir ters transkriptazı ve Cas9 bazlı rRNA tükenmesini içerir ve bu da hücre kaybını azaltır ve transkript yakalamayı iyileştirir. Bu gelişme, mikrobiyolojide yeni bir çağ vaat ediyor ve karmaşık mikrobiyal topluluklarda gen aktivitesinin yüksek çözünürlüklü profilini çıkarmayı sağlıyor.