Công cụ mới đơn giản hóa việc suy luận cây loài từ dữ liệu bộ gen

Các nhà nghiên cứu tại Đại học California San Diego đã phát triển một công cụ mới có tên là ROADIES. Công cụ này đơn giản hóa quá trình suy luận cây loài từ dữ liệu bộ gen thô. Nó làm giảm sự phụ thuộc vào kiến thức chuyên môn và tài nguyên tính toán. ROADIES tự động hóa quá trình suy luận cây loài, giúp các nhà khoa học dễ tiếp cận hơn. Công cụ này sử dụng lấy mẫu ngẫu nhiên các loci từ bộ gen đầu vào, loại bỏ nhu cầu chú thích bộ gen. Cách tiếp cận này cũng làm giảm sức mạnh tính toán cần thiết. Các nhà nghiên cứu đã chứng minh rằng ROADIES tạo ra kết quả tương đương với các nghiên cứu hiện đại. Nó thực hiện điều này trong một phần nhỏ thời gian và công sức. ROADIES có thể được sử dụng cho bất kỳ loài nào và có thể mở rộng quy mô cho các tập dữ liệu với hàng trăm bộ gen. Các nhà nghiên cứu đang nỗ lực cải thiện hơn nữa khả năng của ROADIES. Điều này bao gồm việc đặt các đơn vị phân loại mới trên cây loài hiện có. Họ cũng đang khám phá việc sử dụng GPU để xử lý các tập dữ liệu lớn hơn.