Các nhà nghiên cứu đã phát triển scMINER, một công cụ tính toán mới được thiết kế để phân tích toàn diện dữ liệu giải trình tự RNA tế bào đơn (scRNA-seq). Công cụ này tạo điều kiện thuận lợi cho việc tiền xử lý dữ liệu, phân cụm, suy luận mạng và trực quan hóa thông qua giao diện thân thiện với người dùng. ScMINER nhằm mục đích giúp các nhà nghiên cứu xác định các gen và con đường tín hiệu chính trong các tế bào riêng lẻ, cung cấp thông tin chi tiết về cơ chế tế bào.
ScMINER sử dụng thông tin tương hỗ để đo khoảng cách giữa các tế bào, cho phép phân cụm chính xác và kỹ thuật đảo ngược của mạng lưới gen. Không giống như các phương pháp khác, scMINER không dựa vào các motif liên kết, cho phép đánh giá hoạt động của hơn 6.000 trình điều khiển phiên mã và tín hiệu từ các thí nghiệm scRNA-seq. Công cụ này cũng bao gồm một cổng thông tin dựa trên web để khám phá và chia sẻ dữ liệu scRNA-seq.
Điểm chuẩn đã chứng minh rằng scMINER vượt trội hơn các thuật toán hiện có trong việc phân biệt giữa các loại tế bào T khác nhau và tái cấu trúc chính xác các mạng lưới điều hòa yếu tố phiên mã và mạng lưới tín hiệu. Điều này làm cho scMINER trở thành một tài sản có giá trị cho các nhà nghiên cứu nhằm mục đích mổ xẻ các quá trình tế bào phức tạp và xác định các trình điều khiển ẩn trong dữ liệu omics tế bào đơn. Phần mềm này có thể truy cập công khai.