Một khung mã nguồn mở mới giúp các nhà bảo tồn đánh giá sự hiện diện của đa dạng di gen trong các ngân hàng hạt, hỗ trợ việc bảo vệ các loài thực vật đang đối diện với nguy cơ tuyệt chủng. Điều này rất quan trọng trong việc bảo tồn hệ sinh thái và đảm bảo sự bền vững cho hệ thống thực phẩm của chúng ta.
Khi biến đổi khí hậu và mất môi trường gia tăng, nhiều loài thực vật đang có nguy cơ tuyệt chủng. Các ngân hàng hạt và vườn thực vật đóng một vai trò quan trọng trong việc bảo tồn đa dạng di gen thực vật. Tuy nhiên, chưa đến 20% các loài thực vật hoang dã được đại diện đầy đủ trong các nỗ lực bảo tồn ngoài tự nhiên này.
Marwa El Graoui, một nghiên cứu sinh tiến sĩ tại Đại học Mohammed VI Polytechnic (UM6P) ở Morocco, đã phát triển một khung để giải quyết vấn đề này. Phương pháp của cô sử dụng dữ liệu công khai, mô hình địa lý và phần mềm thân thiện với người dùng để đánh giá sự hiện diện của đa dạng di gen trong các ngân hàng hạt. Điều này cho phép các nhà nghiên cứu ưu tiên các loài cần bảo tồn khẩn cấp.
Công trình của El Graoui tập trung vào chi Vigna, nhưng phương pháp này có thể áp dụng cho bất kỳ nhóm thực vật nào. Khung này sử dụng khoảng cách địa lý và môi trường giữa các mẫu như là đại diện cho sự khác biệt di gen, đặc biệt khi dữ liệu gen trực tiếp không có sẵn. Phương pháp này dựa trên lý thuyết cách ly theo khoảng cách, nơi các quần thể ở xa nhau có xu hướng khác biệt di gen.
Để xác định chính xác phạm vi của một loài, El Graoui và đồng tác giả của cô đã phát triển một phương pháp "phạm vi điều chỉnh". Phương pháp này kết hợp các vùng đệm bao gồm để thu thập các khu vực xảy ra đã được tài liệu hóa và các vùng đệm loại trừ để loại bỏ các khu vực không khả thi được dự đoán bởi các mô hình phân bố loài (SDMs). Nhóm nghiên cứu cũng đã xử lý các sai sót dữ liệu trong các hồ sơ thu thập ngoài tự nhiên, điều này đã ảnh hưởng đáng kể đến các đánh giá bảo tồn.
Tất cả quy trình làm việc được đóng gói vào một thư viện R mã nguồn mở, giúp các nhà nghiên cứu trên toàn thế giới có thể truy cập. Người dùng có thể nhập tọa độ xảy ra và các biến khí hậu để tạo ra một điểm số bảo tồn cho mỗi loài. Cách tiếp cận mã nguồn mở này phù hợp với tầm nhìn của UM6P về việc sử dụng các công cụ kỹ thuật số và dữ liệu châu Phi để giải quyết các thách thức toàn cầu.
Khung sáng tạo này cung cấp một công cụ thực tiễn để nâng cao sự hiện diện của đa dạng di gen trong các ngân hàng hạt. Nó mang lại một giải pháp có thể mở rộng và dễ tiếp cận cho vấn đề cấp bách về bảo tồn thực vật, có lợi cho cả hệ sinh thái và xã hội con người. Bằng cách cải thiện sự hiện diện của đa dạng di gen, chúng ta có thể bảo vệ tốt hơn các loài thực vật và đảm bảo sự bền vững của hệ thống thực phẩm cho các thế hệ tương lai.