Новітній метод під назвою MATQ-seq дозволяє вченим глибше зануритися у складний світ окремих бактеріальних клітин. Ця передова технологія надає профілі експресії генів з високою роздільною здатністю, пропонуючи безпрецедентне розуміння того, як бактерії реагують на різні подразники, включаючи стрес і антибіотики.
MATQ-seq працює шляхом захоплення мРНК, яка виявляє конкретні гени, активні в кожній клітині. На відміну від попередніх методів, MATQ-seq зберігає приблизно 95% клітин, забезпечуючи більш точний і всебічний аналіз поведінки бактерій. Цей покращений коефіцієнт утримання дозволяє дослідникам вивчати навіть невеликі бактеріальні популяції в нішах хазяїна або внутрішньоклітинні бактерії.
Метод може виявляти від 300 до 600 генів на клітину, забезпечуючи глибоке розуміння бактеріальних станів, таких як метаболізм і вірулентність. Розуміючи ці стани, вчені можуть розробляти більш ефективні та цільові методи лікування інфекцій. Покращений протокол MATQ-seq включає автоматизацію, більш ефективну зворотну транскриптазу та виснаження рРНК на основі Cas9, що призводить до зменшення втрати клітин і покращення захоплення транскриптів. Цей прогрес обіцяє нову еру в мікробіології, дозволяючи проводити профілювання генної активності з високою роздільною здатністю у складних мікробних спільнотах.