Teksas Üniversitesi Arlington'daki (UTA) araştırmacılar, BIT (Epigenomik Tabanlı Sorgu Bölgeleri Kümelerinden Transkripsiyonel Düzenleyicilerin Bayesyen Tanımlaması) adlı yeni bir hesaplama aracı geliştirdiler. Bu araç, bilim insanlarının gen ifadesini kontrol eden transkripsiyonel düzenleyiciler (TR'ler) olarak bilinen proteinleri tanımlamasına yardımcı olur. TR'ler, büyüme, gelişim ve hastalık dahil olmak üzere birçok biyolojik süreç için anahtardır. BIT, Bayesyen hiyerarşik modelleme adı verilen bir yöntem kullanır. Bu yaklaşım, farklı kanıt türleri genelinde olasılıkları değerlendirerek, bilim insanlarının aynı anda birden fazla TR'nin aktif olduğu karmaşık durumlarda bile TR'leri daha doğru bir şekilde tanımlamasına olanak tanır. Araç, hangi düzenleyicilerin aktif olduğunu ve nasıl çalıştıklarını göstermek için büyük miktarda veriyi entegre eder. Çalışma, Haziran 2024'te *Nature Communications* dergisinde yayınlandı. TR'ler düzgün çalışmadığında, kanser gibi sağlık sorunlarına neden olabilirler. BIT, araştırmacıların tümörlerin hayatta kalması için önemli olan TR'leri bulmasına yardımcı olabilir. Bu, tümör büyümesini durdurmak için belirli TR'leri hedefleyen yeni tedavilere yol açabilir. Araç ayrıca metabolik bozuklukları ve kalp hastalıklarını incelemede de yardımcı olabilir. BIT'in geliştirilmesi, modern araştırmalarda makine öğrenimi ve ileri istatistiğin önemini vurgulamaktadır. Araştırma, Ulusal Sağlık Enstitüleri ve Teksas Kanser Önleme ve Araştırma Enstitüsü tarafından desteklenmiştir.
Yeni Hesaplama Aracı BIT, Transkripsiyonel Düzenleyicileri Tanımlayarak Gen Araştırmalarına Yardımcı Oluyor
Düzenleyen: Elena HealthEnergy
Kaynaklar
Technology Networks
Bayesian Learning Enhances Accuracy in Gene Research - Bioengineer.org
ZeyuL01/BIT: Bayesian Identification of Transcriptional regulators - GitHub
PMC - BIT: Bayesian Identification of Transcriptional Regulators from Epigenomics-Based Query Region Sets
Biomedical Computing and Intelligent Systems Laboratory - College of Engineering - The University of Texas at Arlington
Biomedical Research in AI and Neuroimaging Laboratory - The University of Texas at Arlington
Integrative Immunology Laboratory - The University of Texas at Arlington
Computational Data Science Lab - The University of Texas at Arlington
Bu konudaki diğer haberlere göz atın:
Bir hata veya yanlışlık buldunuz mu?
Yorumlarınızı en kısa sürede değerlendireceğiz.