Araştırmacılar, tek hücreli RNA dizileme (scRNA-seq) verilerinin kapsamlı analizi için tasarlanmış yeni bir hesaplama aracı olan scMINER'ı geliştirdiler. Bu araç, kullanıcı dostu bir arayüz aracılığıyla veri ön işlemesini, kümelemeyi, ağ çıkarımını ve görselleştirmeyi kolaylaştırır. ScMINER, araştırmacıların tek tek hücreler içindeki temel genleri ve sinyal yollarını belirlemelerine yardımcı olmayı ve hücresel mekanizmalara dair içgörüler sunmayı amaçlamaktadır.
ScMINER, hücreler arasındaki mesafeyi ölçmek için karşılıklı bilgiyi kullanarak doğru kümeleme ve gen ağlarının tersine mühendisliğini sağlar. Diğer yöntemlerin aksine, scMINER bağlanma motiflerine dayanmaz ve scRNA-seq deneylerinden 6.000'den fazla transkripsiyon ve sinyal sürücüsünün aktivite değerlendirmesine olanak tanır. Araç ayrıca scRNA-seq verilerini keşfetmek ve paylaşmak için web tabanlı bir portal içerir.
Kıyaslama, scMINER'ın farklı T hücre türleri arasında ayrım yapmada ve transkripsiyon faktörü düzenleyici ağlarını ve sinyal ağlarını doğru bir şekilde yeniden yapılandırmada mevcut algoritmalardan daha iyi performans gösterdiğini göstermiştir. Bu, scMINER'ı karmaşık hücresel süreçleri incelemeyi ve tek hücreli omik verilerindeki gizli sürücüleri belirlemeyi amaçlayan araştırmacılar için değerli bir varlık haline getirir. Yazılıma halka açık olarak erişilebilir.