YZ, Hedefli Terapiler için Protein Parçacığı İnhibitörlerini Tahmin Ediyor

Yeni bir yöntem olan FragFold, tam uzunluktaki proteinlere bağlanabilen ve onları inhibe edebilen protein parçacıklarını tahmin etmek için yapay zeka kullanır. Biyoloji Bölümü'nde geliştirilen araç, protein katlanmasını ve etkileşimlerini tahmin etmesiyle bilinen bir YZ modeli olan AlphaFold'u kullanır. Araştırmacılar, FragFold'un bağlanma veya inhibisyon tahminlerinin yarısından fazlasının, önceden yapısal veri olmasa bile doğru olduğunu doğruladı. Bu yaklaşım, bilinmeyen işlevlere veya yapılara sahip proteinlere uygulanabilir. Araştırmacılar, hücre bölünmesi için önemli bir protein olan FtsZ'nin parçacıklarını keşfederek yeni bağlanma etkileşimleri belirlediler. Derin mutasyonel tarama, inhibisyondan sorumlu temel amino asitleri ortaya çıkardı ve bazı mutasyona uğramış parçacıklar tam uzunluktaki dizilerden daha güçlü olduğunu kanıtladı. FragFold, protein işlevini manipüle etmek ve hücre biyolojisini incelemek ve hastalıkları tedavi etmek için yeni araçlar oluşturmak için olanaklar sunar.