Yeni geliştirilen açık kaynaklı bir çerçeve, koruma uzmanlarının tohum bankalarındaki genetik çeşitliliğin temsilini değerlendirmesine olanak tanıyor ve nesli tükenme tehlikesiyle karşı karşıya olan bitki türlerinin korunmasına yardımcı oluyor. Bu, ekosistemlerin korunması ve gıda sistemlerimizin dayanıklılığının sağlanması açısından büyük önem taşıyor.
İklim değişikliği ve habitat kaybının hızlanmasıyla birçok bitki türü yok olma riski altında. Tohum bankaları ve botanik bahçeler, bitkilerin genetik çeşitliliğinin korunmasında hayati bir rol oynuyor. Ancak, yabani bitki türlerinin yalnızca %20'sinden azı bu ex situ koruma çabalarında yeterince temsil ediliyor.
Fas'taki Mohammed VI Politeknik Üniversitesi'nde (UM6P) doktora araştırmacısı Marwa El Graoui, bu sorunu ele almak için bir çerçeve geliştirdi. Yöntemi, kamuya açık veriler, mekansal modelleme ve kullanıcı dostu yazılımlar kullanarak tohum bankalarındaki genetik çeşitliliğin temsilini değerlendiriyor. Bu sayede araştırmacılar, acil koruma gerektiren türleri önceliklendirebiliyor.
El Graoui'nin çalışması Vigna cinsine odaklanmakla birlikte, yaklaşım herhangi bir bitki grubuna uygulanabilir. Çerçeve, doğrudan genomik veriler mevcut olmadığında genetik farklılaşmanın göstergesi olarak örnekler arasındaki coğrafi ve çevresel mesafeleri kullanıyor. Bu yaklaşım, uzak popülasyonların genetik olarak farklılaşma eğiliminde olduğu 'uzaklıkla izolasyon' teorisine dayanıyor.
Bir türün dağılım alanını doğru tanımlamak için El Graoui ve eş yazarı "ayarlanmış dağılım" yöntemini geliştirdi. Bu yöntem, belgelenmiş görülme alanlarını kapsayan dahil etme tamponları ile tür dağılım modelleri (SDM'ler) tarafından tahmin edilen olası olmayan bölgeleri çıkaran hariç tutma tamponlarını birleştiriyor. Ekip ayrıca ex situ koleksiyon kayıtlarındaki veri hatalarını ele aldı; bu hatalar koruma değerlendirmelerini önemli ölçüde etkiliyor.
Tüm iş akışı, dünya çapındaki araştırmacıların erişimine açık olan açık kaynaklı bir R kütüphanesi olarak paketlendi. Kullanıcılar, görülme koordinatları ve iklim değişkenlerini girerek her tür için bir koruma puanı oluşturabiliyor. Bu açık kaynak yaklaşımı, UM6P'nin dijital araçlar ve Afrika verilerini kullanarak küresel sorunlara çözüm üretme vizyonuyla uyumlu.
Bu yenilikçi çerçeve, tohum bankalarındaki genetik çeşitliliğin temsilini artırmaya yönelik pratik bir araç sunuyor. Bitki koruma konusunda acil bir sorun olan genetik çeşitliliğin temsilini geliştirmek için ölçeklenebilir ve erişilebilir bir çözüm sağlıyor. Böylece hem ekosistemler hem de insan toplumları fayda sağlıyor. Genetik çeşitliliğin temsilini iyileştirerek, bitki türlerini daha iyi koruyabilir ve gelecek nesiller için gıda sistemlerimizin dayanıklılığını güvence altına alabiliriz.