Bağırsak Mikrobiyomunu İncelemek İçin Anaerobik Kültivasyon Tekniklerindeki Gelişmeler

Mikrobiyom araştırmaları, hastalık tedavisini ve çevresel çözümleri dönüştürüyor. Mikropları kültürlemek, onları tanımlamak ve işlevlerini belirlemek için gereklidir. Ayrıca moleküler veri tahminlerini doğrulamak için kontrollü deneylere olanak tanır. Mevcut anaerobik kültür teknikleri 1960'lardan beri var, ancak yeni stratejiler bunları geliştiriyor. Yüksek verimli anaerobik kültür yöntemleri uygulama zorluklarıyla karşı karşıyadır. Ancak, özellikle bağırsak mikrobiyomu çalışmalarında bilimsel atılımlar yaratabilirler. Bağırsak mikrobiyomu insan sağlığı için çok önemlidir ve anaerobik mikroplar tarafından domine edilir. Yeni nesil kültür yöntemleri, alanı ilişkiden nedenselliğe kaydırabilir. Bilim adamları 60 yıldır bağırsak bakterilerini izole ediyorlar. 'Kültüromikler', kültürlenen mikropların düşük oranını ele almak için 2010'ların başında ortaya çıktı. MALDI-TOF kütle spektrometrisi, hızlı izolat tanımlamasını kolaylaştırır. Bununla birlikte, çoğu kültüromik yaklaşımı manuel kalır ve verim düşüktür. Bakterilerin büyük bir kısmı tanımlanmamış kalır (bağırsak ortamlarında %30-60). Tanımlanan taksonlar için bile, çoğu işlev kötü tanımlanmıştır. Bu mikrobiyal bilinmeyenler, mikrobiyom tabanlı inovasyona meydan okuyor. Tek bir konakta suş evrimini anlamak çok önemlidir, aynı şekilde in vitro kültür sırasında fonksiyonel kaybı önlemek için kontrollü depolama da önemlidir. Yenilikçi anaerobik kültür yöntemleri, uzun zamandır bilinen zorluklarla karşı karşıyadır. Artık bunların üstesinden gelmek için bilgi ve teknolojilere sahibiz. Ölçeklendirilmiş teknikler, izolasyonu, tanımlamayı ve depolamayı artırabilir. Spesifik platformlar, yetiştirilmesi zor türler için kültür koşullarını iyileştirebilir, çoklu fonksiyonel karşılaştırmalar, yüksek çözünürlüklü analiz ve gen düzenlemesi sağlayabilir.