Новый вычислительный инструмент BIT помогает в исследовании генов, выявляя транскрипционные регуляторы

Отредактировано: Elena HealthEnergy

Исследователи из Техасского университета в Арлингтоне (UTA) разработали новый вычислительный инструмент под названием BIT (Байесовская идентификация транскрипционных регуляторов из наборов областей запросов на основе эпигеномики). Этот инструмент помогает ученым идентифицировать белки, известные как транскрипционные регуляторы (ТР), которые контролируют экспрессию генов. ТР являются ключевыми для многих биологических процессов, включая рост, развитие и болезни. BIT использует метод, называемый байесовским иерархическим моделированием. Этот подход оценивает вероятности по различным типам данных, позволяя ученым более точно идентифицировать ТР, даже в сложных ситуациях, когда несколько ТР активны одновременно. Инструмент интегрирует большие объемы данных, чтобы показать, какие регуляторы активны и как они работают. Исследование было опубликовано в журнале *Nature Communications* в июне 2024 года. Когда ТР работают неправильно, они могут вызывать проблемы со здоровьем, такие как рак. BIT может помочь исследователям найти ТР, которые важны для выживания опухолей. Это может привести к новым методам лечения, нацеленным на конкретные ТР, чтобы остановить рост опухоли. Инструмент также может помочь в изучении метаболических расстройств и сердечных заболеваний. Разработка BIT подчеркивает важность машинного обучения и передовой статистики в современных исследованиях. Исследование было поддержано Национальными институтами здравоохранения и Институтом профилактики и исследований рака Техаса.

Источники

  • Technology Networks

  • Bayesian Learning Enhances Accuracy in Gene Research - Bioengineer.org

  • ZeyuL01/BIT: Bayesian Identification of Transcriptional regulators - GitHub

  • PMC - BIT: Bayesian Identification of Transcriptional Regulators from Epigenomics-Based Query Region Sets

  • Biomedical Computing and Intelligent Systems Laboratory - College of Engineering - The University of Texas at Arlington

  • Biomedical Research in AI and Neuroimaging Laboratory - The University of Texas at Arlington

  • Integrative Immunology Laboratory - The University of Texas at Arlington

  • Computational Data Science Lab - The University of Texas at Arlington

Вы нашли ошибку или неточность?

Мы учтем ваши комментарии как можно скорее.

Новый вычислительный инструмент BIT помога... | Gaya One