Przełomowa metoda o nazwie MATQ-seq umożliwia naukowcom zagłębienie się w zawiły świat pojedynczych komórek bakteryjnych. Ta zaawansowana technologia zapewnia profile ekspresji genów w wysokiej rozdzielczości, oferując bezprecedensowy wgląd w to, jak bakterie reagują na różne bodźce, w tym stres i antybiotyki.
MATQ-seq działa poprzez wychwytywanie mRNA, które ujawnia specyficzne geny aktywne w każdej komórce. W przeciwieństwie do poprzednich metod, MATQ-seq zatrzymuje około 95% komórek, zapewniając dokładniejszą i bardziej kompleksową analizę zachowania bakterii. Ta poprawiona retencja pozwala badaczom na badanie nawet małych populacji bakterii w niszy gospodarza lub bakterii wewnątrzkomórkowych.
Technika ta może wykryć od 300 do 600 genów na komórkę, zapewniając głęboki wgląd w stany bakteryjne, takie jak metabolizm i wirulencja. Rozumiejąc te stany, naukowcy mogą opracowywać bardziej skuteczne i ukierunkowane metody leczenia infekcji. Ulepszony protokół MATQ-seq obejmuje automatyzację, bardziej wydajną odwrotną transkryptazę i oparte na Cas9 uszczuplenie rRNA, co prowadzi do zmniejszenia utraty komórek i poprawy wychwytywania transkryptów. Ten postęp zapowiada nową erę w mikrobiologii, umożliwiając profilowanie aktywności genów w wysokiej rozdzielczości w złożonych społecznościach mikrobiologicznych.