Nieuwe rekentool BIT helpt genenonderzoek door transcriptieregulatoren te identificeren

Onderzoekers aan de Universiteit van Texas in Arlington (UTA) hebben een nieuwe rekentool ontwikkeld genaamd BIT (Bayesian Identification of Transcriptional Regulators from Epigenomics-Based Query Regions Sets). Deze tool helpt wetenschappers bij het identificeren van eiwitten, bekend als transcriptieregulatoren (TR's), die de genexpressie controleren. TR's zijn cruciaal voor veel biologische processen, waaronder groei, ontwikkeling en ziekte. BIT maakt gebruik van een methode genaamd Bayesiaanse hiërarchische modellering. Deze aanpak beoordeelt waarschijnlijkheden over verschillende soorten bewijs, waardoor wetenschappers TR's nauwkeuriger kunnen identificeren, zelfs in complexe situaties waarin meerdere TR's tegelijkertijd actief zijn. De tool integreert grote hoeveelheden gegevens om te laten zien welke regulatoren actief zijn en hoe ze werken. De studie werd in juni 2024 gepubliceerd in het tijdschrift *Nature Communications*. Wanneer TR's niet correct functioneren, kunnen ze gezondheidsproblemen veroorzaken, zoals kanker. BIT kan onderzoekers helpen TR's te vinden die belangrijk zijn voor het overleven van tumoren. Dit zou kunnen leiden tot nieuwe behandelingen die zich richten op specifieke TR's om tumorgroei te stoppen. De tool kan ook helpen bij het bestuderen van stofwisselingsstoornissen en hartaandoeningen. De ontwikkeling van BIT benadrukt het belang van machine learning en geavanceerde statistiek in modern onderzoek. Het onderzoek werd ondersteund door de National Institutes of Health en het Cancer Prevention and Research Institute of Texas.