Een baanbrekende methode genaamd MATQ-seq stelt wetenschappers in staat om dieper in de complexe wereld van individuele bacteriële cellen te duiken. Deze geavanceerde technologie biedt hoge-resolutie genexpressieprofielen, die ongekende inzichten bieden in hoe bacteriën reageren op verschillende stimuli, waaronder stress en antibiotica.
MATQ-seq werkt door mRNA vast te leggen, wat de specifieke genen onthult die actief zijn in elke cel. In tegenstelling tot eerdere methoden behoudt MATQ-seq ongeveer 95% van de cellen, waardoor een nauwkeurigere en uitgebreidere analyse van bacterieel gedrag wordt gegarandeerd. Deze verbeterde retentie stelt onderzoekers in staat om zelfs kleine bacteriële populaties in gastheerniches of intracellulaire bacteriën te bestuderen.
De techniek kan tussen de 300 en 600 genen per cel detecteren, wat diepgaande inzichten biedt in bacteriële toestanden zoals metabolisme en virulentie. Door deze toestanden te begrijpen, kunnen wetenschappers effectievere en gerichtere behandelingen voor infecties ontwikkelen. Het verbeterde MATQ-seq-protocol omvat automatisering, een efficiëntere reverse transcriptase en Cas9-gebaseerde rRNA-depletie, wat leidt tot minder celverlies en een betere transcriptvastlegging. Deze vooruitgang belooft een nieuw tijdperk in de microbiologie, waardoor hoge-resolutie profilering van genactiviteit in complexe microbiële gemeenschappen mogelijk wordt.