Nieuwe software identificeert verouderende cellen om chronische ziekten te bestrijden

Onderzoekers van de University of Illinois Chicago (UIC) hebben SenePy ontwikkeld, een open-source softwareplatform, om vroegtijdig verouderende cellen, ook wel senescente cellen genoemd, te identificeren. Deze cellen, die stoppen met groeien maar niet sterven, dragen bij aan ziekten zoals hart- en vaatziekten en de ziekte van Alzheimer. Mark Sanborn, een promovendus aan de UIC, analyseerde single-cell sequencing data van meer dan 1,6 miljoen menselijke en muizencellen om SenePy te creëren. De tool identificeert genetische signaturen die senescente cellen onderscheiden van gezonde cellen in verschillende weefsels, waaronder het hart, de longen en de hersenen. De onderzoekers identificeerden 72 muizen- en 64 menselijke signaturen. Dr. Jalees Rehman, hoofdauteur en Benjamin J. Goldberg Professor, verklaarde dat SenePy onderzoekers helpt deze cellen te bestuderen om ziekten beter te begrijpen en te behandelen. Het platform maakt analyse van weefselmonsters en vergelijking met de ontdekte database van signaturen mogelijk. De onderzoekers gebruikten SenePy om de rol van senescente cellen bij kanker, hartaanvallen, COVID-19 en hersenontsteking te onderzoeken. Ze ontdekten dat senescente cellen zich samenklonteren en dat senescentie kan fungeren als een natuurlijke rem op tumorvorming. Het team beoordeelde ook de effectiviteit van senolytische medicijnen, die senescente cellen opruimen, en identificeerde potentiële nieuwe doelen voor deze medicijnen. Het onderzoek werd gefinancierd door subsidies van de National Institutes of Health.