カリフォルニア大学サンディエゴ校の研究者らは、ROADIESと呼ばれる新しいツールを開発しました。このツールは、生のゲノムデータから種系統樹を推定するプロセスを簡素化します。専門知識と計算リソースへの依存を軽減します。
ROADIESは、種系統樹の推定プロセスを自動化し、科学者がよりアクセスしやすくします。このツールは、入力ゲノムからランダムに遺伝子座をサンプリングし、ゲノムアノテーションの必要性を排除します。このアプローチは、必要な計算能力も削減します。
研究者らは、ROADIESが最先端の研究に匹敵する結果を生み出すことを実証しました。これは、ほんのわずかな時間と労力で実現します。ROADIESは、あらゆる種に使用でき、数百のゲノムを含むデータセットに拡張可能です。
研究者らは、ROADIESの機能をさらに改善するために取り組んでいます。これには、既存の種系統樹への新しい分類群の配置が含まれます。また、より大きなデータセットを処理するためのGPUの使用も検討しています。
この記事は、著者がMirage.Newsから入手した資料の分析に基づいています。