MITの研究者たちは、ゲノムの3D構造を迅速に予測する画期的なAIモデルChromoGenを開発しました。以前は数週間かかっていた作業が、わずか数分で達成できるようになりました。Science Advancesで詳細に説明されているこのイノベーションは、深層学習と生成AIを組み合わせてDNA配列とクロマチンアクセシビリティを分析し、数千ものクロマチン構造を迅速に生成することを可能にします。
ゲノムの3D構造は、遺伝子発現と細胞の多様性を決定します。ChromoGenは、DNA配列を分析する部分と、1100万以上のクロマチン構造のトレーニングセットに基づいて3D構造を予測する生成AIコンポーネントの2つの部分からなるシステムを使用します。これにより、研究者は3Dゲノム構造が遺伝子発現と細胞機能にどのように影響するかをより効率的に研究できます。
MITの化学准教授であるBin Zhangが率いるチームのAIモデルは、現在の実験技術よりもはるかに高速に、数分で数千ものクロマチン構造を予測できます。モデルの予測は実験データと一致し、他の細胞型からのデータを正確に予測するため、クロマチンの変動とその機能的影響を調査するための貴重なツールとなります。研究者たちは、モデルとデータを公開し、さらなる科学的探求を促しています。