寄生虫の堆積DNAが、7世紀にヨーロッパの高山湖に魚が導入されたことを明らかにする

編集者: Katia Remezova Cath

Nature Communicationsに掲載された研究で、研究者らは寄生虫の堆積DNAを使用して、7世紀に遡るヨーロッパの高山湖への魚種の古代の導入を明らかにしました。この発見は、歴史的な人間と環境の相互作用に関する私たちの理解を再構築します。また、過去の生態学的および人為的な出来事を再構築する上での堆積古代DNA(sedaDNA)分析の可能性も示しています。 この研究は、ヨーロッパの遠隔地の高山湖に焦点を当てました。研究者らは、数千年にわたる堆積物コアを分析し、魚に感染することが知られている寄生生物から保存されたDNA断片を抽出し、配列決定しました。これらの寄生虫DNAマーカーは、魚の存在と人間が媒介した導入の指標として機能し、生態学的歴史を再構築するためのプロキシを提供しました。 堆積DNA(sedaDNA)とは、環境堆積物中に保存されている遺伝物質を指します。この研究では、特定の魚の宿主にリンクされた寄生虫DNAを強調し、魚の個体数の動態と導入に関するニュアンスのあるシグナルを提供しました。寄生虫はしばしば宿主と共移動するため、この区別は重要です。 研究チームは、堆積物コアサンプリング、古代DNA抽出プロトコル、およびハイスループットシーケンシングを組み合わせました。彼らは、固有の寄生虫個体群と、非在来魚種とともに導入された個体群とを区別するために、寄生虫分類群を特定しました。中世初期に対応する堆積層は、湖に固有ではない魚に関連する寄生虫DNAのシグナルを示しました。 この証拠は、人間が推進する魚の導入を示唆する歴史的な仮説と一致しています。これらの導入は、自給自足のニーズまたは資源管理によって動機付けられた可能性があります。非在来の魚の寄生虫の存在は、人間の活動が文書化されたよりも数世紀前に湖沼生物相の組成を変化させたことを意味します。 この研究は、種の侵入に関連する生態学的変化を検出できるバイオインジケーターとしての寄生虫sedaDNAの有用性を確認しています。このアプローチは、過去の病気の生態を理解するためのプロキシを提供します。魚の導入が1000年以上前に発生したことを認識することは、現代の政策立案者が歴史的なベースラインを統合することを義務付けています。 この研究は、堆積DNAの時間分解能の能力を強調しています。研究者らは、寄生虫DNAの出現と消失の微細な時間的マッピングを達成しました。研究チームは、他の高山湖からの堆積物コアが、未開拓の寄生虫DNAアーカイブを保持している可能性があることを強調しています。 古代DNAは、分解や汚染の影響を受けやすいです。分離技術と汚染管理の革新は、有益な配列を取得するために非常に重要でした。この研究は、過去の生物多様性と人為的影響を再構築するためのレンズとして、寄生虫の堆積DNAの説得力のあるケースを構築しています。 調査結果は、古代のコミュニティが彼らの環境を操作したという物語を明らかにしています。この相互作用は、歴史的に、現在の生物多様性のパターンと生態学的健康に影響を与え続けている生態系の軌道を形成しました。寄生虫sedaDNAのマルチプロキシ環境再構築への統合は、古生物学的調査に革命をもたらすことが期待されています。

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