ハクシカの高品質ゲノムアセンブリが適応メカニズムを解明

編集者: Katia Remezova Cath

PacBioおよびHi-Cシーケンスデータを使用して、ハクシカ(Przewalskium albirostris)の高品質な染色体レベルのリファレンスゲノムが構築されました。アセンブリの合計は2.99 GBで、34個の染色体で構成されています。研究者らは21909個のタンパク質コード遺伝子を特定し、そのうち21859個をegapxソフトウェアを使用してアノテーションしました。

ハクシカは、青海チベット高原の極端な気候に独自に適応しています。このシカは、その属の唯一の種であり、密猟や生息地の喪失の脅威に直面しています。新しいゲノムアセンブリは、シカの適応メカニズムの理解に大きく貢献するでしょう。

第3世代シーケンス技術は、以前のゲノムアセンブリの制限を克服するために利用されました。これにより、シカの極端な環境への適応の分子メカニズムに関する将来の研究のための貴重なリソースが提供されます。遺伝子発現パターンに関する研究、適応に関連する遺伝的変異の特定、および適応の進化の歴史の探求が容易になります。

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