नया उपकरण जीनोम डेटा से प्रजाति वृक्ष अनुमान को सरल बनाता है

कैलिफोर्निया विश्वविद्यालय सैन डिएगो के शोधकर्ताओं ने ROADIES नामक एक नया उपकरण विकसित किया है। यह उपकरण कच्चे जीनोम डेटा से प्रजाति वृक्षों का अनुमान लगाने की प्रक्रिया को सरल बनाता है। यह डोमेन विशेषज्ञता और कम्प्यूटेशनल संसाधनों पर निर्भरता को कम करता है। ROADIES प्रजाति वृक्षों का अनुमान लगाने की प्रक्रिया को स्वचालित करता है, जिससे वैज्ञानिकों के लिए यह अधिक सुलभ हो जाता है। उपकरण इनपुट जीनोम से लोकी का एक यादृच्छिक नमूना उपयोग करता है, जिससे जीनोम एनोटेशन की आवश्यकता समाप्त हो जाती है। यह दृष्टिकोण आवश्यक कंप्यूटिंग शक्ति को भी कम करता है। शोधकर्ताओं ने प्रदर्शित किया कि ROADIES अत्याधुनिक अध्ययनों के समान परिणाम उत्पन्न करता है। यह समय और प्रयास के एक अंश में ऐसा करता है। ROADIES का उपयोग किसी भी प्रजाति के लिए किया जा सकता है और यह सैकड़ों जीनोम वाले डेटासेट के लिए स्केलेबल है। शोधकर्ता ROADIES की क्षमताओं को और बेहतर बनाने के लिए काम कर रहे हैं। इसमें मौजूदा प्रजाति वृक्षों पर नए टैक्सन रखना शामिल है। वे बड़े डेटासेट को संसाधित करने के लिए GPU के उपयोग की भी खोज कर रहे हैं।