सफेद होंठ वाले हिरण का उच्च-गुणवत्ता वाला जीनोम असेंबली अनुकूलन तंत्र को प्रकट करता है

द्वारा संपादित: Katia Remezova Cath

PacBio और Hi-C अनुक्रमण डेटा का उपयोग करके सफेद होंठ वाले हिरण (Przewalskium albirostris) के लिए एक उच्च-गुणवत्ता, क्रोमोसोम-स्तरीय संदर्भ जीनोम का निर्माण किया गया है। असेंबली कुल 2.99 GB है और इसमें 34 क्रोमोसोम शामिल हैं। शोधकर्ताओं ने 21909 प्रोटीन कोडिंग जीन की पहचान की, जिनमें से 21859 को egapx सॉफ़्टवेयर का उपयोग करके एनोटेट किया गया।

सफेद होंठ वाला हिरण अद्वितीय रूप से किंघई-तिब्बत पठार की चरम जलवायु के अनुकूल है। यह हिरण अपनी जीनस में एकमात्र प्रजाति है और इसे अवैध शिकार और आवास नुकसान से खतरा है। नया जीनोम असेंबली हिरण के अनुकूलन तंत्र को समझने में महत्वपूर्ण योगदान देगा।

पिछली जीनोम असेंबली की सीमाओं को दूर करने के लिए तीसरी पीढ़ी की अनुक्रमण तकनीकों का उपयोग किया गया। यह हिरण के चरम वातावरण के अनुकूलन के आणविक तंत्र पर भविष्य के अनुसंधान के लिए मूल्यवान संसाधन प्रदान करता है। यह जीन अभिव्यक्ति पैटर्न के अध्ययन, अनुकूलन से जुड़े आनुवंशिक विविधताओं की पहचान करने और अनुकूलन के विकासवादी इतिहास की खोज की सुविधा प्रदान करता है।

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