टोमोसेकर: बेहतर अनुसंधान के लिए नया सॉफ्टवेयर 3डी जीन अभिव्यक्ति को विज़ुअलाइज़ करता है

त्सुकुबा, जापान की एक टीम ने "टोमोसेकर" विकसित किया है, जो 3डी जीन अभिव्यक्ति पैटर्न को विज़ुअलाइज़ और विश्लेषण करने के लिए डिज़ाइन किया गया एक सॉफ्टवेयर सूट है। यह नवाचार जीन अभिव्यक्ति के स्थानिक वितरण को समझने की चुनौतियों का समाधान करता है, जो विकासात्मक जीव विज्ञान, रोग अनुसंधान और पुनर्योजी चिकित्सा के लिए महत्वपूर्ण है। आरएनए टोमोग्राफी के रूप में जानी जाने वाली विधि, ऊतकों के भीतर जीन अभिव्यक्ति के विस्तृत 3डी मानचित्र बनाती है। आरएनए टोमोग्राफी में तीन ऑर्थोगोनल अक्षों के साथ संरेखित जमे हुए ऊतक वर्गों की तैयारी और उसके बाद आरएनए अनुक्रमण शामिल है। परिणामी डेटा को तब जीन गतिविधि दिखाने वाले 3डी मॉडल को फिर से बनाने के लिए सुपरइम्पोज किया जाता है। टोमोसेकर एक उपयोगकर्ता के अनुकूल इंटरफेस के साथ इस प्रक्रिया को सरल करता है, ऊतक आकृति विज्ञान डेटा निर्माण और 3डी जीन अभिव्यक्ति मॉडल विज़ुअलाइज़ेशन में सहायता करता है। सॉफ्टवेयर की प्रभावशीलता को ज़ेब्राफिश का उपयोग करके प्रदर्शित किया गया, जहां इसने ज्ञात जीन अभिव्यक्ति पैटर्न को पुन: पेश किया। शोधकर्ताओं ने प्लानरियन्स में लगभग 18,000 जीन का भी विश्लेषण किया, जो उनकी पुनर्योजी क्षमताओं के लिए जाने जाते हैं, स्थानिक उतार-चढ़ाव वाले जीन की पहचान करते हैं जो संभावित रूप से घाव भरने और पुनर्जन्म से जुड़े होते हैं। टोमोसेकर को बायोकोन्डक्टर द्वारा अपनाया गया है, जिससे सहयोग और संसाधन साझाकरण में वृद्धि हुई है। शोधकर्ताओं का मानना है कि टोमोसेकर आनुवंशिक रोगों की समझ और लक्षित उपचारों के विकास को आगे बढ़ा सकता है। इसकी पहुंच अंतःविषय अनुसंधान को बढ़ावा देती है, जिससे संभावित रूप से तेजी से वैज्ञानिक सफलताएं मिलती हैं।

* Matsuzawa R, Kawahara D, Kashima M, Hirata H, Ozaki H (2025) tomoseqr: A Bioconductor package for spatial reconstruction and visualization of 3D gene expression patterns based on RNA tomography. PLoS ONE 20(1)