Un método innovador llamado MATQ-seq está permitiendo a los científicos profundizar en el intrincado mundo de las células bacterianas individuales. Esta tecnología avanzada proporciona perfiles de expresión génica de alta resolución, ofreciendo información sin precedentes sobre cómo las bacterias responden a diversos estímulos, incluido el estrés y los antibióticos.
MATQ-seq funciona capturando el ARNm, que revela los genes específicos que están activos dentro de cada célula. A diferencia de los métodos anteriores, MATQ-seq retiene aproximadamente el 95% de las células, lo que garantiza un análisis más preciso y completo del comportamiento bacteriano. Esta tasa de retención mejorada permite a los investigadores estudiar incluso pequeñas poblaciones bacterianas en nichos de huéspedes o bacterias intracelulares.
La técnica puede detectar entre 300 y 600 genes por célula, proporcionando información profunda sobre los estados bacterianos como el metabolismo y la virulencia. Al comprender estos estados, los científicos pueden desarrollar tratamientos más eficaces y dirigidos para las infecciones. El protocolo MATQ-seq mejorado incorpora automatización, una transcriptasa inversa más eficiente y depleción de ARNr basada en Cas9, lo que lleva a una reducción de la pérdida de células y una mejor captura de transcritos. Este avance promete una nueva era en la microbiología, permitiendo la creación de perfiles de alta resolución de la actividad génica en comunidades microbianas complejas.