ШІ прогнозує інгібітори білкових фрагментів для цільової терапії

Новий метод, FragFold, використовує штучний інтелект для прогнозування білкових фрагментів, які можуть зв'язуватися та інгібувати повнорозмірні білки. Розроблений у Департаменті біології, інструмент використовує AlphaFold, модель ШІ, відому прогнозуванням згортання та взаємодії білків. Дослідники підтвердили, що понад половина передбачень FragFold щодо зв'язування або інгібування були точними, навіть без попередніх структурних даних. Цей підхід можна застосовувати до білків з невідомими функціями або структурами. Дослідники вивчили фрагменти FtsZ, білка, ключового для поділу клітин, виявивши нові зв'язуючі взаємодії. Глибоке мутаційне сканування виявило ключові амінокислоти, відповідальні за інгібування, причому деякі мутовані фрагменти виявилися потужнішими за повнорозмірні послідовності. FragFold відкриває можливості для маніпулювання функцією білків і створення нових інструментів для вивчення клітинної біології та лікування хвороб.