Нове програмне забезпечення ідентифікує старіючі клітини для боротьби з хронічними захворюваннями

Дослідники з Університету Іллінойсу в Чикаго (UIC) розробили SenePy, програмну платформу з відкритим вихідним кодом, для ідентифікації клітин, що передчасно старіють, також відомих як старіючі клітини. Ці клітини, які припиняють рости, але не вмирають, сприяють розвитку таких захворювань, як серцево-судинні захворювання та хвороба Альцгеймера. Марк Санборн, докторант UIC, проаналізував дані секвенування окремих клітин із понад 1,6 мільйона клітин людини та миші, щоб створити SenePy. Інструмент ідентифікує генетичні сигнатури, які відрізняють старіючі клітини від здорових у різних тканинах, включаючи серце, легені та мозок. Дослідники ідентифікували 72 сигнатури миші та 64 сигнатури людини. Д-р Джаліс Рехман, провідний автор і професор Бенджамін Дж. Голдберг, заявив, що SenePy допомагає дослідникам вивчати ці клітини, щоб краще розуміти та лікувати хвороби. Платформа дозволяє аналізувати зразки тканин і порівнювати їх із виявленою базою даних сигнатур. Дослідники використовували SenePy для вивчення ролі старіючих клітин у розвитку раку, серцевих нападів, COVID-19 і запалення мозку. Вони виявили, що старіючі клітини збираються разом і що старіння може діяти як природне гальмо утворення пухлин. Команда також оцінила ефективність сенолітичних препаратів, які очищають старіючі клітини, і виявила потенційні нові цілі для цих препаратів. Дослідження фінансувалося за рахунок грантів Національних інститутів здоров’я.