Исследователи из Калифорнийского университета в Сан-Диего разработали новый инструмент под названием ROADIES. Этот инструмент упрощает процесс вывода видовых деревьев из необработанных геномных данных. Он снижает зависимость от экспертных знаний и вычислительных ресурсов.
ROADIES автоматизирует процесс вывода видовых деревьев, делая его более доступным для ученых. Инструмент использует случайную выборку локусов из входных геномов, устраняя необходимость в аннотации генома. Этот подход также снижает требуемую вычислительную мощность.
Исследователи продемонстрировали, что ROADIES дает результаты, сопоставимые с современными исследованиями. При этом он делает это за меньшее время и с меньшими усилиями. ROADIES можно использовать для любого вида, и он масштабируется для наборов данных с сотнями геномов.
Исследователи работают над дальнейшим улучшением возможностей ROADIES. Это включает в себя размещение новых таксонов на существующих видовых деревьях. Они также изучают использование графических процессоров для обработки больших наборов данных.
Эта статья основана на анализе нашего автора материалов, взятых из следующего источника: Mirage.News.