Осадочная ДНК паразитов раскрывает информацию о внедрении рыбы в европейское высокогорное озеро в VII веке

В исследовании, опубликованном в журнале Nature Communications, исследователи использовали осадочную ДНК паразитов, чтобы выявить древнее внедрение видов рыб в европейское высокогорное озеро, датируемое VII веком. Это открытие меняет наше понимание исторических взаимодействий человека и окружающей среды. Оно также демонстрирует потенциал анализа осадочной древней ДНК (sedaDNA) в реконструкции прошлых экологических и антропогенных событий. Исследование было сосредоточено на отдаленном альпийском озере в Европе. Исследователи проанализировали керны отложений, охватывающие тысячелетия, извлекая и секвенируя сохранившиеся фрагменты ДНК паразитических организмов, известных тем, что они заражают рыб. Эти маркеры ДНК паразитов служили индикаторами присутствия рыбы и опосредованных человеком внедрений, предлагая прокси для реконструкции экологической истории. Осадочная ДНК (sedaDNA) относится к генетическому материалу, сохранившемуся в экологических отложениях. В исследовании особое внимание уделялось паразитической ДНК, связанной с конкретными хозяевами рыб, что обеспечивало нюансированный сигнал динамики популяций рыб и внедрений. Это различие имеет решающее значение, поскольку паразиты часто ко-мигрируют со своими хозяевами. Исследовательская группа объединила отбор проб кернов отложений, протоколы извлечения древней ДНК и высокопроизводительное секвенирование. Они идентифицировали таксоны паразитов, чтобы различать эндемичные популяции паразитов и те, которые были внедрены с неместными видами рыб. В слоях отложений, соответствующих раннему средневековью, были обнаружены сигналы ДНК паразитов, связанных с рыбами, не являющимися коренными для озера. Эти данные согласуются с историческими гипотезами, предполагающими внедрение рыбы, вызванное деятельностью человека. Эти внедрения могли быть мотивированы потребностями в средствах к существованию или управлением ресурсами. Присутствие неместных рыбных паразитов подразумевает, что деятельность человека изменила состав озерной биоты на столетия раньше, чем это было задокументировано. Это исследование подтверждает полезность sedaDNA паразитов в качестве биоиндикатора, который может обнаруживать экологические изменения, связанные с вторжением видов. Этот подход предлагает прокси для понимания экологии болезней в прошлом. Признание того, что внедрение рыбы произошло более тысячелетия назад, обязывает современных политиков интегрировать исторические базовые показатели. В исследовании подчеркиваются возможности временного разрешения осадочной ДНК. Исследователи добились детального хронологического картирования появления и исчезновения ДНК паразитов. Исследовательская группа подчеркивает, что керны отложений из других высокогорных озер могут содержать неиспользованные архивы ДНК паразитов. Древняя ДНК восприимчива к деградации и загрязнению. Инновации в методах изоляции и контроле загрязнения имели решающее значение для извлечения информативных последовательностей. Это исследование убедительно доказывает, что осадочная ДНК паразитов является линзой для реконструкции прошлого биоразнообразия и антропогенного воздействия. Результаты раскрывают историю, в которой древние сообщества манипулировали своей окружающей средой. Это взаимодействие исторически формировало траектории экосистем, которые продолжают влиять на современные модели биоразнообразия и экологическое здоровье. Интеграция sedaDNA паразитов в многофакторные экологические реконструкции обещает революционизировать палеобиологические исследования.