Um novo quadro de código aberto ajuda os conservacionistas a avaliar a representação da diversidade genética em bancos de sementes, auxiliando na proteção de espécies de plantas em risco de extinção. Isso é crucial para preservar ecossistemas e garantir a resiliência dos nossos sistemas alimentares.
À medida que as mudanças climáticas e a perda de habitat aceleram, muitas espécies de plantas estão em risco de extinção. Bancos de sementes e jardins botânicos desempenham um papel vital na preservação da diversidade genética das plantas. No entanto, menos de 20% das espécies de plantas silvestres estão adequadamente representadas nesses esforços de conservação ex situ.
Marwa El Graoui, uma pesquisadora de doutorado na Universidade Mohammed VI Polytechnic (UM6P) em Marrocos, desenvolveu um quadro para abordar essa questão. Seu método utiliza dados disponíveis publicamente, modelagem geoespacial e software amigável para avaliar a representação da diversidade genética em bancos de sementes. Isso permite que os pesquisadores priorizem espécies que necessitam de conservação urgente.
O trabalho de El Graoui foca no gênero Vigna, mas a abordagem pode ser aplicada a qualquer grupo de plantas. O quadro utiliza distâncias geográficas e ambientais entre amostras como proxies para diferenciação genética, especialmente quando dados genômicos diretos não estão disponíveis. Essa abordagem é baseada na teoria da isolamento por distância, onde populações mais distantes tendem a divergir geneticamente.
Para definir com precisão a faixa de uma espécie, El Graoui e seu coautor desenvolveram um método de "faixa ajustada". Esse método combina buffers de inclusão para capturar zonas de ocorrência documentadas e buffers de exclusão para remover áreas implausíveis previstas por modelos de distribuição de espécies (SDMs). A equipe também abordou imprecisões nos dados dos registros de coleta ex situ, que impactaram significativamente as avaliações de conservação.
Todo o fluxo de trabalho é empacotado em uma biblioteca R de código aberto, tornando-a acessível a pesquisadores em todo o mundo. Os usuários podem inserir coordenadas de ocorrência e variáveis climáticas para gerar uma pontuação de conservação para cada espécie. Essa abordagem de código aberto está alinhada com a visão da UM6P de utilizar ferramentas digitais e dados africanos para enfrentar desafios globais.
Esse quadro inovador fornece uma ferramenta prática para melhorar a representação da diversidade genética em bancos de sementes. Oferece uma solução escalável e acessível para a questão premente da conservação de plantas, beneficiando tanto os ecossistemas quanto a sociedade humana. Ao melhorar a representação da diversidade genética, podemos proteger melhor as espécies de plantas e garantir a resiliência de nossos sistemas alimentares para as gerações futuras.