Avanços nas Técnicas de Cultivo Anaeróbico para Estudar o Microbioma Intestinal

A pesquisa do microbioma está transformando o tratamento de doenças e as soluções ambientais. Cultivar micróbios é essencial para descrevê-los e definir suas funções. Também permite experimentos controlados para validar previsões de dados moleculares. As técnicas atuais de cultura anaeróbica existem desde a década de 1960, mas novas estratégias estão aprimorando-as. Os métodos de cultivo anaeróbico de alto rendimento enfrentam desafios de implementação. No entanto, eles podem gerar avanços científicos, especialmente em estudos do microbioma intestinal. O microbioma intestinal é crucial para a saúde humana e dominado por micróbios anaeróbicos. Os métodos de cultivo de próxima geração podem mudar o campo da associação para a causalidade. Os cientistas têm isolado bactérias intestinais há 60 anos. A 'culturomia' surgiu no início dos anos 2010 para abordar a baixa fração de micróbios cultivados. A espectrometria de massas MALDI-TOF facilita a identificação rápida de isolados. No entanto, a maioria das abordagens de culturomia permanece manual e o rendimento é baixo. Uma grande fração de bactérias permanece não descrita (30-60% em ambientes intestinais). Mesmo para os táxons descritos, a maioria das funções é mal definida. Essas incógnitas microbianas desafiam a inovação baseada no microbioma. Compreender a evolução da cepa em um único hospedeiro é crucial, assim como o armazenamento controlado para evitar a perda funcional durante o cultivo in vitro. Métodos inovadores de cultivo anaeróbico enfrentam desafios reconhecidos há muito tempo. Agora temos o conhecimento e as tecnologias para superá-los. Técnicas ampliadas podem impulsionar o isolamento, a identificação e o armazenamento. Plataformas específicas podem melhorar as condições de cultura para espécies difíceis de cultivar, permitindo comparações funcionais multiplexadas, análise de alta resolução e edição de genes.