Nowe narzędzie obliczeniowe BIT wspomaga badania genów poprzez identyfikację regulatorów transkrypcji

Naukowcy z The University of Texas at Arlington (UTA) opracowali nowe narzędzie obliczeniowe o nazwie BIT (Bayesian Identification of Transcriptional Regulators from Epigenomics-Based Query Regions Sets). Narzędzie to pomaga naukowcom identyfikować białka, znane jako regulatory transkrypcji (TRs), które kontrolują ekspresję genów. TRs są kluczowe dla wielu procesów biologicznych, w tym wzrostu, rozwoju i chorób. BIT wykorzystuje metodę zwaną bayesowskim modelowaniem hierarchicznym. Podejście to ocenia prawdopodobieństwa w różnych typach dowodów, pozwalając naukowcom na dokładniejsze identyfikowanie TRs, nawet w złożonych sytuacjach, w których wiele TRs jest aktywnych jednocześnie. Narzędzie integruje duże ilości danych, aby pokazać, które regulatory są aktywne i jak działają. Badanie zostało opublikowane w czasopiśmie *Nature Communications* w czerwcu 2024 roku. Kiedy TRs nie działają poprawnie, mogą powodować problemy zdrowotne, takie jak rak. BIT może pomóc naukowcom znaleźć TRs, które są ważne dla przeżycia guza. Może to prowadzić do nowych metod leczenia, które ukierunkowane są na specyficzne TRs, aby zatrzymać wzrost guza. Narzędzie może również pomóc w badaniu zaburzeń metabolicznych i chorób serca. Opracowanie BIT podkreśla znaczenie uczenia maszynowego i zaawansowanej statystyki we współczesnych badaniach. Badania zostały wsparte przez National Institutes of Health i Cancer Prevention and Research Institute of Texas.