I ricercatori dell'Università della California di San Diego hanno sviluppato un nuovo strumento chiamato ROADIES. Questo strumento semplifica il processo di inferenza degli alberi filogenetici a partire dai dati genomici grezzi. Riduce la dipendenza dalla competenza nel settore e dalle risorse computazionali.
ROADIES automatizza il processo di inferenza degli alberi filogenetici, rendendolo più accessibile agli scienziati. Lo strumento utilizza un campionamento casuale di loci dai genomi di input, eliminando la necessità di annotazione del genoma. Questo approccio riduce anche la potenza di calcolo richiesta.
I ricercatori hanno dimostrato che ROADIES produce risultati comparabili agli studi più avanzati. Lo fa in una frazione del tempo e dello sforzo. ROADIES può essere utilizzato per qualsiasi specie ed è scalabile a set di dati con centinaia di genomi.
I ricercatori stanno lavorando per migliorare ulteriormente le capacità di ROADIES. Ciò include il posizionamento di nuovi taxa sugli alberi filogenetici esistenti. Stanno anche esplorando l'uso di GPU per l'elaborazione di set di dati più grandi.
Questo articolo si basa sull'analisi del nostro autore di materiali tratti dalla seguente risorsa: Mirage.News.