Il nuovo strumento computazionale BIT aiuta la ricerca genetica identificando i regolatori trascrizionali

Modificato da: Elena HealthEnergy

I ricercatori dell'Università del Texas ad Arlington (UTA) hanno sviluppato un nuovo strumento computazionale chiamato BIT (Identificazione Bayesiana dei Regolatori Trascrizionali da Set di Regioni di Query basati sull'Epigenomica). Questo strumento aiuta gli scienziati a identificare le proteine, note come regolatori trascrizionali (RT), che controllano l'espressione genica. I RT sono fondamentali per molti processi biologici, tra cui la crescita, lo sviluppo e le malattie. BIT utilizza un metodo chiamato modellazione gerarchica bayesiana. Questo approccio valuta le probabilità attraverso diversi tipi di evidenza, consentendo agli scienziati di identificare i RT in modo più accurato, anche in situazioni complesse in cui più RT sono attivi contemporaneamente. Lo strumento integra grandi quantità di dati per mostrare quali regolatori sono attivi e come funzionano. Lo studio è stato pubblicato sulla rivista *Nature Communications* nel giugno 2024. Quando i RT non funzionano correttamente, possono causare problemi di salute come il cancro. BIT può aiutare i ricercatori a trovare i RT che sono importanti per la sopravvivenza dei tumori. Ciò potrebbe portare a nuovi trattamenti che prendono di mira specifici RT per arrestare la crescita tumorale. Lo strumento può anche aiutare nello studio dei disturbi metabolici e delle malattie cardiache. Lo sviluppo di BIT evidenzia l'importanza del machine learning e della statistica avanzata nella ricerca moderna. La ricerca è stata supportata dai National Institutes of Health e dal Cancer Prevention and Research Institute of Texas.

Fonti

  • Technology Networks

  • Bayesian Learning Enhances Accuracy in Gene Research - Bioengineer.org

  • ZeyuL01/BIT: Bayesian Identification of Transcriptional regulators - GitHub

  • PMC - BIT: Bayesian Identification of Transcriptional Regulators from Epigenomics-Based Query Region Sets

  • Biomedical Computing and Intelligent Systems Laboratory - College of Engineering - The University of Texas at Arlington

  • Biomedical Research in AI and Neuroimaging Laboratory - The University of Texas at Arlington

  • Integrative Immunology Laboratory - The University of Texas at Arlington

  • Computational Data Science Lab - The University of Texas at Arlington

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