Un metodo rivoluzionario chiamato MATQ-seq sta consentendo agli scienziati di approfondire l'intricato mondo delle singole cellule batteriche. Questa tecnologia avanzata fornisce profili di espressione genica ad alta risoluzione, offrendo informazioni senza precedenti su come i batteri rispondono a vari stimoli, tra cui stress e antibiotici.
MATQ-seq funziona catturando l'mRNA, che rivela i geni specifici che sono attivi all'interno di ogni cellula. A differenza dei metodi precedenti, MATQ-seq trattiene circa il 95% delle cellule, garantendo un'analisi più accurata e completa del comportamento batterico. Questo tasso di ritenzione migliorato consente ai ricercatori di studiare anche piccole popolazioni batteriche in nicchie ospiti o batteri intracellulari.
La tecnica può rilevare tra 300 e 600 geni per cellula, fornendo informazioni approfondite sugli stati batterici come il metabolismo e la virulenza. Comprendendo questi stati, gli scienziati possono sviluppare trattamenti più efficaci e mirati per le infezioni. Il protocollo MATQ-seq migliorato incorpora l'automazione, una trascrittasi inversa più efficiente e la deplezione di rRNA basata su Cas9, portando a una riduzione della perdita di cellule e a una migliore cattura dei trascritti. Questo progresso promette una nuova era nella microbiologia, consentendo la profilazione ad alta risoluzione dell'attività genica in complesse comunità microbiche.