L'assemblaggio del genoma di alta qualità del cervo dalle labbra bianche rivela meccanismi di adattamento

Modificato da: Katia Remezova Cath

Un genoma di riferimento di alta qualità, a livello cromosomico, per il cervo dalle labbra bianche (Przewalskium albirostris) è stato costruito utilizzando dati di sequenziamento PacBio e Hi-C. L'assemblaggio ammonta a 2,99 GB e comprende 34 cromosomi. I ricercatori hanno identificato 21909 geni codificanti per proteine, annotandone 21859 utilizzando il software egapx.

Il cervo dalle labbra bianche è adattato in modo univoco ai climi estremi dell'altopiano Qinghai-Tibet. Questo cervo è l'unica specie del suo genere e deve affrontare minacce derivanti dal bracconaggio e dalla perdita di habitat. Il nuovo assemblaggio del genoma contribuirà in modo significativo alla comprensione dei meccanismi di adattamento del cervo.

Sono state utilizzate tecnologie di sequenziamento di terza generazione per superare i limiti dei precedenti assemblaggi del genoma. Questo fornisce preziose risorse per la ricerca futura sui meccanismi molecolari di adattamento nei cervi ad ambienti estremi. Facilita gli studi sui modelli di espressione genica, l'identificazione di variazioni genetiche associate all'adattamento e l'esplorazione della storia evolutiva degli adattamenti.

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