Para peneliti di University of California San Diego telah mengembangkan alat baru bernama ROADIES. Alat ini menyederhanakan proses menyimpulkan pohon spesies dari data genom mentah. Ini mengurangi ketergantungan pada keahlian domain dan sumber daya komputasi.
ROADIES mengotomatiskan proses menyimpulkan pohon spesies, membuatnya lebih mudah diakses oleh para ilmuwan. Alat ini menggunakan pengambilan sampel acak lokus dari genom input, menghilangkan kebutuhan akan anotasi genom. Pendekatan ini juga mengurangi daya komputasi yang dibutuhkan.
Para peneliti menunjukkan bahwa ROADIES menghasilkan hasil yang sebanding dengan studi mutakhir. Ini melakukannya dalam waktu dan upaya yang lebih singkat. ROADIES dapat digunakan untuk spesies apa pun dan dapat diskalakan ke kumpulan data dengan ratusan genom.
Para peneliti sedang berupaya untuk lebih meningkatkan kemampuan ROADIES. Ini termasuk menempatkan taksa baru pada pohon spesies yang ada. Mereka juga menjajaki penggunaan GPU untuk memproses kumpulan data yang lebih besar.
Artikel ini didasarkan pada analisis penulis kami terhadap materi yang diambil dari sumber berikut: Mirage.News.