Para peneliti telah mengembangkan scMINER, alat komputasi baru yang dirancang untuk analisis komprehensif data pengurutan RNA sel tunggal (scRNA-seq). Alat ini memfasilitasi pra-pemrosesan data, pengelompokan, inferensi jaringan, dan visualisasi melalui antarmuka yang mudah digunakan. ScMINER bertujuan untuk membantu peneliti mengidentifikasi gen kunci dan jalur pensinyalan di dalam sel individu, menawarkan wawasan tentang mekanisme seluler.
ScMINER menggunakan informasi timbal balik untuk mengukur jarak antara sel, memungkinkan pengelompokan yang akurat dan rekayasa balik jaringan gen. Tidak seperti metode lain, scMINER tidak bergantung pada motif pengikatan, memungkinkan penilaian aktivitas lebih dari 6.000 transkripsi dan driver pensinyalan dari eksperimen scRNA-seq. Alat ini juga menyertakan portal berbasis web untuk menjelajahi dan berbagi data scRNA-seq.
Pengujian telah menunjukkan bahwa scMINER mengungguli algoritma yang ada dalam membedakan antara berbagai jenis sel T dan secara akurat merekonstruksi jaringan regulasi faktor transkripsi dan jaringan pensinyalan. Hal ini menjadikan scMINER aset berharga bagi para peneliti yang bertujuan untuk membedah proses seluler yang kompleks dan mengidentifikasi driver tersembunyi dalam data omik sel tunggal. Perangkat lunak ini dapat diakses secara publik.