Sebuah metode inovatif yang disebut MATQ-seq memungkinkan para ilmuwan untuk menyelidiki dunia rumit sel bakteri individu. Teknologi canggih ini menyediakan profil ekspresi gen resolusi tinggi, menawarkan wawasan yang belum pernah terjadi sebelumnya tentang bagaimana bakteri merespons berbagai rangsangan, termasuk stres dan antibiotik.
MATQ-seq bekerja dengan menangkap mRNA, yang mengungkapkan gen spesifik yang aktif di dalam setiap sel. Tidak seperti metode sebelumnya, MATQ-seq mempertahankan sekitar 95% sel, memastikan analisis perilaku bakteri yang lebih akurat dan komprehensif. Tingkat retensi yang ditingkatkan ini memungkinkan para peneliti untuk mempelajari bahkan populasi bakteri kecil di relung inang atau bakteri intraseluler.
Teknik ini dapat mendeteksi antara 300 dan 600 gen per sel, memberikan wawasan mendalam tentang keadaan bakteri seperti metabolisme dan virulensi. Dengan memahami keadaan ini, para ilmuwan dapat mengembangkan perawatan yang lebih efektif dan ditargetkan untuk infeksi. Protokol MATQ-seq yang ditingkatkan menggabungkan otomatisasi, transkriptase balik yang lebih efisien, dan penipisan rRNA berbasis Cas9, yang mengarah pada pengurangan kehilangan sel dan peningkatan penangkapan transkrip. Kemajuan ini menjanjikan era baru dalam mikrobiologi, memungkinkan pembuatan profil resolusi tinggi dari aktivitas gen dalam komunitas mikroba yang kompleks.