AI Memprediksi Inhibitor Fragmen Protein untuk Terapi Bertarget

Metode baru, FragFold, menggunakan kecerdasan buatan untuk memprediksi fragmen protein yang dapat berikatan dan menghambat protein dengan panjang penuh. Dikembangkan di Departemen Biologi, alat ini memanfaatkan AlphaFold, model AI yang dikenal karena memprediksi pelipatan dan interaksi protein. Para peneliti mengkonfirmasi bahwa lebih dari setengah prediksi FragFold untuk pengikatan atau penghambatan akurat, bahkan tanpa data struktural sebelumnya. Pendekatan ini dapat diterapkan pada protein dengan fungsi atau struktur yang tidak diketahui. Para peneliti mengeksplorasi fragmen FtsZ, protein kunci untuk pembelahan sel, mengidentifikasi interaksi pengikatan baru. Pemindaian mutasi mendalam mengungkapkan asam amino kunci yang bertanggung jawab untuk penghambatan, dengan beberapa fragmen yang bermutasi terbukti lebih kuat daripada urutan panjang penuh. FragFold membuka kemungkinan untuk memanipulasi fungsi protein dan membuat alat baru untuk mempelajari biologi sel dan mengobati penyakit.