Investigadores de la Universidad de California en San Diego han desarrollado una nueva herramienta llamada ROADIES. Esta herramienta simplifica el proceso de inferir árboles de especies a partir de datos genómicos brutos. Reduce la dependencia de la experiencia en el dominio y los recursos computacionales.
ROADIES automatiza el proceso de inferir árboles de especies, haciéndolo más accesible a los científicos. La herramienta utiliza un muestreo aleatorio de loci de genomas de entrada, eliminando la necesidad de anotación del genoma. Este enfoque también reduce la potencia informática requerida.
Los investigadores demostraron que ROADIES produce resultados comparables a los de los estudios más avanzados. Lo hace en una fracción del tiempo y el esfuerzo. ROADIES se puede utilizar para cualquier especie y es escalable a conjuntos de datos con cientos de genomas.
Los investigadores están trabajando para mejorar aún más las capacidades de ROADIES. Esto incluye la colocación de nuevos taxones en árboles de especies existentes. También están explorando el uso de GPU para procesar conjuntos de datos más grandes.
Este artículo se basa en el análisis de nuestro autor de materiales tomados del siguiente recurso: Mirage.News.