Un nuevo estudio arroja luz sobre las mutaciones de novo (MDN), cambios genéticos presentes en un individuo pero ausentes en sus padres. Estas mutaciones son cruciales para comprender el desarrollo de enfermedades y los procesos evolutivos. Los investigadores han superado las limitaciones de estudios anteriores utilizando tecnologías de secuenciación avanzadas y una referencia más completa del genoma humano.
El estudio se centró en una familia de cuatro generaciones (CEPH 1463), ampliamente estudiada en genética. Se aplicaron cinco tecnologías de secuenciación a los genomas de 28 miembros de la familia. El objetivo era identificar variantes de un solo nucleótido (VSN), inserciones y deleciones (indels) y variantes estructurales en el ADN de muestras de sangre.
Los investigadores accedieron a 260 millones de pares de bases más del genoma en comparación con estudios anteriores. La tasa de transmisión estimada es de 98 a 206 MDN por generación, superior a las estimaciones anteriores. "Alrededor del 16% de las MDN fueron postcigóticas y, mientras que las MDN de la línea germinal fueron de origen paterno en un 81,4%, las MDN postcigóticas no muestran sesgo de origen parental".
El estudio reveló que las tasas de MDN varían según el contenido de repeticiones de la región. "En general, la línea germinal parental contribuye con 1,17 × 10 VSN por par de bases por generación, y esta tasa casi se triplica en las repeticiones de los centrómeros y casi se duplica en las secuencias repetidas llamadas duplicaciones segmentarias". También se observaron altas tasas de mutación en la heterocromatina y las regiones de repeticiones en tándem.
Los investigadores identificaron 32 sitios con mutaciones recurrentes en la familia. Ensamblaron 288 centrómeros completos y validaron 18 variantes estructurales de novo de 150 eventos de transmisión. La investigación proporciona datos valiosos sobre la genómica humana y la transmisión intergeneracional de variaciones genéticas, incluso en regiones genómicas complejas.