KI sagt Proteinfragment-Inhibitoren für gezielte Therapien voraus

Eine neue Methode, FragFold, nutzt künstliche Intelligenz, um Proteinfragmente vorherzusagen, die an vollständige Proteine binden und diese hemmen können. Das im Fachbereich Biologie entwickelte Tool nutzt AlphaFold, ein KI-Modell, das für die Vorhersage von Proteinfaltung und -interaktionen bekannt ist. Forscher bestätigten, dass über die Hälfte der FragFold-Vorhersagen für Bindung oder Hemmung korrekt waren, selbst ohne vorherige Strukturdaten. Dieser Ansatz könnte auf Proteine mit unbekannten Funktionen oder Strukturen angewendet werden. Die Forscher untersuchten Fragmente von FtsZ, einem Protein, das für die Zellteilung von Bedeutung ist, und identifizierten neue Bindungsinteraktionen. Tiefgreifendes Mutationsscanning enthüllte wichtige Aminosäuren, die für die Hemmung verantwortlich sind, wobei sich einige mutierte Fragmente als wirksamer erwiesen als vollständige Sequenzen. FragFold eröffnet Möglichkeiten zur Manipulation der Proteinfunktion und zur Entwicklung neuer Werkzeuge zur Untersuchung der Zellbiologie und zur Behandlung von Krankheiten.