scMINER: উন্নত সিঙ্গেল-সেল আরএনএ সিকোয়েন্সিং ডেটা বিশ্লেষণ এবং লুকানো ড্রাইভার সনাক্তকরণের জন্য একটি নতুন সরঞ্জাম

গবেষকরা scMINER তৈরি করেছেন, যা সিঙ্গেল-সেল আরএনএ সিকোয়েন্সিং (scRNA-seq) ডেটার ব্যাপক বিশ্লেষণের জন্য ডিজাইন করা একটি নতুন কম্পিউটেশনাল সরঞ্জাম। এই সরঞ্জামটি ব্যবহারকারী-বান্ধব ইন্টারফেসের মাধ্যমে ডেটা প্রিপ্রসেসিং, ক্লাস্টারিং, নেটওয়ার্ক অনুমান এবং ভিজ্যুয়ালাইজেশনকে সহজ করে তোলে। ScMINER এর লক্ষ্য হল গবেষকদের পৃথক কোষের মধ্যে মূল জিন এবং সিগন্যালিং পাথওয়ে সনাক্ত করতে সাহায্য করা, যা সেলুলার প্রক্রিয়া সম্পর্কে অন্তর্দৃষ্টি প্রদান করে।

ScMINER কোষগুলির মধ্যে দূরত্ব পরিমাপ করতে পারস্পরিক তথ্য ব্যবহার করে, যা সঠিক ক্লাস্টারিং এবং জিন নেটওয়ার্কের বিপরীত-প্রকৌশল সক্ষম করে। অন্যান্য পদ্ধতির বিপরীতে, ScMINER বাইন্ডিং মোটিফের উপর নির্ভর করে না, যা scRNA-seq পরীক্ষা থেকে 6,000 টিরও বেশি ট্রান্সক্রিপশন এবং সিগন্যালিং ড্রাইভারের কার্যকলাপ মূল্যায়ন করতে দেয়। সরঞ্জামটিতে scRNA-seq ডেটা অন্বেষণ এবং ভাগ করার জন্য একটি ওয়েব-ভিত্তিক পোর্টালও রয়েছে।

বেঞ্চমার্কিং প্রমাণ করেছে যে scMINER বিভিন্ন ধরণের টি কোষের মধ্যে পার্থক্য করতে এবং ট্রান্সক্রিপশন ফ্যাক্টর নিয়ন্ত্রক নেটওয়ার্ক এবং সিগন্যালিং নেটওয়ার্কগুলিকে সঠিকভাবে পুনর্গঠন করতে বিদ্যমান অ্যালগরিদমগুলির চেয়ে ভাল পারফর্ম করে। এটি scMINER কে জটিল সেলুলার প্রক্রিয়াগুলিকে বিচ্ছিন্ন করতে এবং একক-কোষ ওমিক্স ডেটাতে লুকানো ড্রাইভার সনাক্তকরণের লক্ষ্যে গবেষকদের জন্য একটি মূল্যবান সম্পদ করে তোলে। সফ্টওয়্যারটি সর্বজনীনভাবে অ্যাক্সেসযোগ্য।