সুকুবা, জাপানের একটি দল "টোমোসেকর" তৈরি করেছে, যা 3D জিন এক্সপ্রেশন প্যাটার্ন ভিজ্যুয়ালাইজ এবং বিশ্লেষণ করার জন্য ডিজাইন করা একটি সফটওয়্যার স্যুট। এই উদ্ভাবনটি জিন এক্সপ্রেশনের স্থানিক বিতরণ বোঝার চ্যালেঞ্জ মোকাবেলা করে, যা বিকাশের জীববিজ্ঞান, রোগ গবেষণা এবং পুনর্জন্মমূলক চিকিৎসার জন্য অত্যন্ত গুরুত্বপূর্ণ। আরএনএ টমোগ্রাফি নামক পদ্ধতিটি টিস্যুগুলির মধ্যে জিন এক্সপ্রেশনের বিস্তারিত 3D মানচিত্র তৈরি করে। আরএনএ টমোগ্রাফিতে তিনটি অর্থোগোনাল অক্ষের সাথে সারিবদ্ধ হিমায়িত টিস্যু বিভাগগুলির প্রস্তুতি এবং তারপরে আরএনএ সিকোয়েন্সিং জড়িত। ফলস্বরূপ ডেটা তখন জিন কার্যকলাপ প্রদর্শন করে এমন একটি 3D মডেল পুনর্গঠন করতে সুপারইম্পোজ করা হয়। টোমোসেকর একটি ব্যবহারকারী-বান্ধব ইন্টারফেসের সাথে এই প্রক্রিয়াটিকে সহজ করে তোলে, টিস্যু মর্ফোলজি ডেটা তৈরি এবং 3D জিন এক্সপ্রেশন মডেল ভিজ্যুয়ালাইজেশনে সহায়তা করে। সফটওয়্যারটির কার্যকারিতা জেব্রাফিশ ব্যবহার করে প্রদর্শিত হয়েছে, যেখানে এটি পরিচিত জিন এক্সপ্রেশন প্যাটার্নগুলি পুনরুত্পাদন করে। গবেষকরা প্ল্যানারিয়ান্সে প্রায় 18,000 জিন বিশ্লেষণ করেছেন, যা তাদের পুনর্জন্মমূলক ক্ষমতার জন্য পরিচিত, স্থানিক ওঠানামা সহ জিন সনাক্ত করে যা সম্ভাব্যভাবে ক্ষত নিরাময় এবং পুনর্জন্মের সাথে যুক্ত। টোমোসেকর বায়োকন্ডাক্টর দ্বারা গৃহীত হয়েছে, যা সহযোগিতা এবং সম্পদ ভাগ করে নেওয়া বাড়িয়েছে। গবেষকরা বিশ্বাস করেন যে টোমোসেকর জেনেটিক রোগের বোঝা এবং লক্ষ্যযুক্ত চিকিত্সার বিকাশকে আরও বাড়িয়ে তুলতে পারে। এর অ্যাক্সেসযোগ্যতা আন্তঃবিষয়ক গবেষণা প্রচার করে, সম্ভাব্য দ্রুত বৈজ্ঞানিক সাফল্যের দিকে পরিচালিত করে।
* Matsuzawa R, Kawahara D, Kashima M, Hirata H, Ozaki H (2025) tomoseqr: A Bioconductor package for spatial reconstruction and visualization of 3D gene expression patterns based on RNA tomography. PLoS ONE 20(1)